1. Torpaqların genezisi, coğrafiyası və kartoqrafiyası laboratoriyası;
2. Torpaq örtüyünün strukturası laboratoriyası;
3. Torpaqların aqroekologiyası və bonitirovkası laboratoriyası;
4. Torpaqların mineralogiyası və kimyası laboratoriyası;
5. Torpaqların biologiyası laboratoriyası;
6.Torpaq coğrafi informasiya sistemləri laboratoriyası;
7. Torpaq fizikası laboratoriyası;
8. Torpaq meliorasiyası laboratoriyası;
9. Torpaqların rekultivasiyası laboratoriyası;
10.Mineral gübrələr laboratoriyası;
11. Mikroelementlər və mikrogübrələr laboratoriyası;
12. Üzvü gübrələr laboratoriyası;
13. Torpaq proseslərinin dinamikası laboratoriyası;
14. Torpaq-aqrokimyəvi tədqiqatlar və kütləvi analizlər laboratoriyası;